Das Wurzelstockfräsen bzw. das Baumstumpffräsen wird in der Regel im Anschluss an das Fällen eines Baumes erledigt. Zumeist verwendet man beim Stubbenfräsen ein forstwirtschaftliches Arbeitsgerät zum Entfernen von Baumstumpen.
Eine Stubbenfräse besitzt zumeist einen hydraulischen Antrieb für Fräsarm und Frässcheibe. Ohne eigenen Antrieb, kann die Wurzelfräse auch als Anbaugerät für Traktoren oder Radlader und Bagger betrieben werden. Die Frässcheibe besteht häufig aus festem Verschleißblech (Hardox), versehen mit austauschbaren hartmetallbelegten Fräszähnen.
Die Baumstümpfe werden mit Hilfe der Wurzelstockfräsen zu Holzspänen zerkleinert, welche als Mulch vor Ort belassen werden können. Ein Ausgraben der Stümpfe ist dadurch nicht mehr erforderlich.